| プロローグ０ | コズミック・イラの歴史 | 簡単なコズミック・イラの歴史 | プロローグ１ | 隠された真実 | キラ・ヤマトが生まれる少し前、メンデルにそれはあった。 | プロローグ２ | 新たに生まれた成功体 | ついにユーレンはやがて世界に重要な存在となるキラをこの世へ生み出した。 |
| プロローグ３ | 青き清浄なる世界のために | キラの存在を知ったブルーコスモスはメンデル襲撃を開始する。 | プロローグ４ | 目覚めた超人ＶＳテロリスト | 目覚める二人の者、そして、彼らは生きるために戦場を走る。 |
| プロローグ５ | 双子の別れと養子 | メンデルから脱出したヤマト夫妻。彼らはユーレンと旧知の仲であるウズミの元へ。 | プロローグ６ | メンデル脱出後のプラント | メンデルを脱出したセイの行く先は・・・。一方で、変なパロディも登場。 |
| プロローグ７ | メンデル襲撃後の地球 | シャトルがたどり着いた先で、それぞれの運命は決まろうとしていた。 | プロローグ８ | 星を見る者と目覚める者 | スウェンの数奇な運命、そしてクランプは・・・。 |
| プロローグ９ | それぞれの生活 | あの事件以後、生活は様々だった。 | プロローグ１０ | 思いがけぬ誕生日プレゼント | １０歳の誕生日、マサカズの運命は本格的に動き出した。 |
| プロローグ１１ | 穏やかな日々を奪った日 | サハク家の野望に巻き込まれるサキートはまだ５歳だった・・・。 | プロローグ１２ | ３名の脱走 | カナードの脱走に便乗する後の叢雲劾とグゥド・ヴェイア。 |
| プロローグ１３ | 狼ＶＳ狩人 | 成長したガルグの前に立ちはだかるは有名なバウンティハンターだった。 | プロローグ１４ | コペルニクスの出会いと別れ、そして…悲劇 | マサカズは幼年学校へと転入する。そして、別れの日は早くも訪れた。 |
| プロローグ１５ | 血のバレンタイン | 見回りに出ていたハンターのロイラートは非常事態に戦闘を開始する。 | プロローグ１６ | 駆け抜ける独立部隊、それは… | メンデルへ攻撃を行おうとしたクットールに謎のＭＳ隊が襲撃する |
| プロローグ１７ | 本物の傭兵(前編) | イライジャと劾の出会いが明かされる。 | プロローグ１８ | 本物の傭兵(後編) | 上の話の後編。何故か名無しのキャラに名前がついている。ということは・・・？ |
| プロローグ１９ | ＡＳＴＲＡＹの開発経緯 | 本格的に動き出すオーブのそれぞれの陣営。 | プロローグ２０ | 標的はヘリオポリスのＭＳ | ヘリオポリスでのＭＳの建造が知られ、それぞれは動き出すのであった。 |